PH-1635

Terug naar Cursusaanbod 2010

Terug naar Moleculaire biologie 2010

Workshop primer en probe design

Deze cursus is vol! U kunt zich aanmelden voor de eerstvolgende Primer en probe (PH-1636)

Om een succesvolle (Real-Time) PCR bepaling te kunnen ontwikkelen zijn goede primers en probes essentieel. Zij karakteriseren immers de amplimeren en bepalen de specificiteit ervan. Parameters als Tm, stringentie, fidelity en sequentiegegevens (o.a. neiging tot hairpin-vorming, uniciteit, bindingssterkte en basenvolgorde, kruishybridisatie,mogelijke interactie tussen primers), zijn essentieel. Diverse firm's brengen softwarepakketten op de markt die een grote verscheidenheid in ontwerpkeuze aanbieden. Tijdens de workshop wordt kennis gemaakt met 'Beacon Designer' en komen de mogelijkheden en beperkingen van 'web-based' primer programma's als Primer 3 aan de orde. BLAST-analyses zijn een hulpmiddel bij de selectie van een adequaat primerpaar, een TaqMan probe of een Molecular Beacon. Tevens wordt een overzicht gegeven van bekende en minder bekende producten als 'hairpin' probes, 'scorpion' primers, 'molecular beacons', 'dual probes' en de eigenschappen van de fluorochromen. Ook komen er tips om de bruikbaarheid van geselecteerde primers te controleren.

Deze compacte workshop geeft laboratoriummedewerkers die werken met conventionele en 'Real-Time' PCR niet alleen 'up-to-date' informatie over primer en probe design en biedt diverse 'tips and trics' die de specificiteit van de PCR kunnen verbeteren. Aan de cursus is een basaal bio-informaticapracticum verbonden, waarin de belangrijkste stappen van primer design aan de hand van een concreet voorbeeld en met behulp van 'web-based' programma's en Beacon Designer worden behandeld. Tijdens de tweede cursusdag is er ruimte voor casusbespreking, waarbij cursisten worden uitgenodigd een casus in te dienen.

Doelgroep: laboratoriummedewerkers op HBO-niveau die hun kennis van primers en probes willen aanvullen

Cursusniveau: HBO

Cursusdata: 11 en 12 februari 2010

Lestijden: 09.30 - 17.00 uur

Omvang: 6 uur theorie; 6 uur bio-informatica practicum

Getuigschrift: Bewijs van deelname

Inschrijving: vóór 6 weken voor cursusaanvang via het inschrijfformulier

Cursusprijs: € 420,- (met vroegboekkorting € 395,-)